Sempre que quero clonar discos ou partições eu usava o comando "dd" nativo do linux, mas ele é pouco didático, já que não mostra andamento da cópia e a gente tem que ficar monitorando em outro terminal para ter noção de como anda a cópia e se não travou.
Para solucionar isso, achei um programa interessante:
dcfldd = "Department of Defense Computer Forensics Lab" dd
Que pode ser instalado diretamente pelo "apt-get install dcfldd" no Debian ou baixado em http://dcfldd.sourceforge.net/ e instalado conforme sua própria distro.
Ele trabalha com os mesmos parâmetros do "dd".
Mais informações, no site do próprio desenvolvedor.
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